獸藥殘留是指畜禽產品用藥后殘留的原型藥物或其代謝產物，包括與獸藥有關的雜質殘留。在我國畜牧業快速發展的背景下，畜產品消費逐年增加。但是，受經濟利益的驅使，受科學知識的限制，一些農民或水產養殖植物長期使用藥物異常(濫用藥物添加劑和抗生素；未能嚴格遵守停藥期的相關規定)導致獸藥過度使用問題普遍存在，導致動物源性食品中獸藥殘留問題，也給消費者利益造成一定損害。

事實上，獸藥殘留對人體造成的危害已經開始顯現，具體癥狀有三種(致突變、致畸、致癌)效應、過敏反應、激素效應、細菌耐藥性等。

獸藥殘留還可以通過食物鏈和外部環境間接影響生態環境。

常見的動物源性食品包括蛋白質合成代謝類固醇、鎮靜劑、抗球蟲藥、磺胺類藥物和抗生素。動物源性食品樣品的基質復雜，食品種類繁多，理化性質差異較大，檢測成分多，目標特殊類別多。如何簡單處理分析檢測方法，提高凈化效率和檢測率，有效提高檢測靈敏度，已成為獸藥殘留分析中最重要的研究課題之一。

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